The KNOTTIN database |
knottin card: 1dkc |
General data | Collier de Perles | |
PDB ID | 1dkc Chain: A Length: 38 |
![]() |
Downloads | Renumbered PDB file |
|
Nomenclature | (6)8.0(3)10 | |
Family | Plant antimicrobial | |
Descriptor | PAFP-, ANTIFUNGAL PEPTIDE | |
Experimental | SOLUTION NMR Resolution: NOT APPLI BMRB | |
Source | PHYTOLACCA AMERICANA | |
Function | Antifungal | |
Publication | D.C.WANG et al. 1999 | |
Links | SwissProt // PDB // PDBsum // MMDB // PubMed |
Sequence and Structure help | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number | 18 | 19 | 20 | 21 | 22 | 23 | 37 | 38 | 39 | 40 | 41 | 42 | 43 | 44 | 56 | 57 | 58 | 59 | 60 | 61 | 62 | 78 | 79 | 80 | 81 | 82 | 83 | 84 | 85 | 95 | 96 | 97 | 98 | 99 | 100 | 101 | 102 | 103 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Residue | A | G | C | I | K | N | G | G | R | C | N | A | S | A | G | P | P | Y | C | C | S | S | Y | C | F | Q | I | A | G | Q | S | Y | G | V | C | K | N | R | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary | C | C | C | T | T | T | T | E | E | E | T | T | T | T | T | T | C | C | T | T | T | T | E | E | E | E | E | T | T | T | T | E | E | E | E | E | C | C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phi | 360 | -69 | -155 | -128 | -77 | -91 | 125 | -99 | -108 | -142 | -146 | -76 | -93 | -122 | 84 | -67 | -75 | -169 | -91 | -75 | -123 | 71 | -105 | -152 | -102 | -125 | -120 | -87 | -162 | -111 | 67 | -137 | -129 | -117 | -88 | -151 | -76 | -151 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Psi | -175 | 164 | 174 | 125 | -51 | 61 | 61 | 156 | 131 | 173 | 99 | -11 | -15 | 38 | 78 | 110 | -78 | 138 | -178 | -32 | 27 | -4 | 148 | 117 | 109 | 149 | 164 | 91 | -69 | 5 | 58 | 136 | 151 | 136 | 152 | -173 | -167 | 360 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ASA | 121 | 75 | 65 | 96 | 90 | 131 | 45 | 5 | 154 | 9 | 28 | 60 | 67 | 76 | 56 | 79 | 100 | 124 | 18 | 23 | 21 | 78 | 79 | 45 | 111 | 46 | 76 | 113 | 63 | 154 | 52 | 88 | 0 | 64 | 2 | 72 | 71 | 188 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PAC | 85 | 100 | 39 | 64 | 45 | 80 | 100 | 0 | 72 | 7 | 25 | 66 | 28 | 73 | 100 | 63 | 90 | 59 | 5 | 9 | 17 | 64 | 45 | 33 | 66 | 12 | 49 | 100 | 100 | 82 | 46 | 53 | 0 | 67 | 4 | 55 | 46 | 61 |